El laboratorio de la Región Este de Udelar: de la ecología acuática a los análisis clínicos de covid-19 РUruguay Natural Marca Pais

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El laboratorio de la sede universitaria de Rocha ha procesado 240 muestras y trabajará, además, en la secuenciación del virus SARS-CoV-2.

‚ÄúEstas cosas no pasan de la noche a la ma√Īana. Nos llev√≥ tres meses crear este laboratorio ‚Äďporque hubo que crear una parte de laboratorio que no exist√≠a‚Äď y fue posible porque hace diez a√Īos que estamos instalados en la regi√≥n trabajando y formando gente para trabajar en esas t√©cnicas. Es gente que est√° s√ļper bien formada, gente joven, entusiasmada, comprometida, y eso se logra haciendo apuestas a largo plazo; si no ten√©s a la gente preparada, si no ten√©s los laboratorios montados, si no ten√©s el equipamiento, no lo pod√©s hacer‚ÄĚ, explic√≥ en di√°logo con la diaria Cecilia Alonso, responsable del Laboratorio de Ecolog√≠a Molecular del Centro Universitario de la Regi√≥n Este de la Universidad de la Rep√ļblica (CURE-Udelar).

Alonso lidera el equipo de estudiantes y docentes que, luego de hacer algunos ajustes y de incorporar un protocolo espec√≠fico, crearon el Laboratorio de An√°lisis de Covid-19 y pasaron as√≠ de estudiar muestras de sistemas acu√°ticos a manipular muestras humanas para detectar, mediante la t√©cnica molecular de PCR, el virus SARS-CoV-2. Este laboratorio comenz√≥ a funcionar el 17 de julio y se apoya en un convenio para hacer el diagn√≥stico de covid-19 entre la Udelar y el Ministerio de Salud P√ļblica (MSP). Es el tercero que monta la Udelar en el interior del pa√≠s; los otros dos se crearon en Salto y en Tacuaremb√≥.

Hasta ahora, el laboratorio rochense ha procesado 240 muestras de usuarios de la Administración de los Servicios de Salud del Estado (ASSE) del departamento y, en la medida de lo posible, empezará a procesar muestras que provengan de los departamentos vecinos.

La génesis
El medioambiente, la biodiversidad y la ecolog√≠a junto con la costa y la pesca son dos de los ejes tem√°ticos que propuso la Udelar para la regi√≥n este en 2011, cuando convoc√≥ a la creaci√≥n de polos de desarrollo universitario. La sede universitaria de Rocha, que se ubica en el cruce de las rutas 9 y 15, no exist√≠a en aquel entonces, y los investigadores de la ecolog√≠a acu√°tica ‚Äďentre ellos Alonso‚Äď empezaron a trabajar en la sede del Programa de Conservaci√≥n de la Biodiversidad y Desarrollo Sustentable en los Humedales del Este (Probides) y montaron sus laboratorios en contenedores. A fines de 2012, cuando se inaugur√≥ la sede actual, mudaron los laboratorios, y los contenedores pasaron a cumplir otras funciones, excepto uno, que qued√≥ en desuso; ese contenedor es el que ahora recibe las muestras de los hisopados para detectar covid-19, relat√≥ Alonso.

La mudanza del contenedor de Probides al CURE estaba prevista para otro uso, pero la emergencia sanitaria termin√≥ d√°ndole un fin insospechado. Es que en medio de la pandemia, los investigadores empezaron a pensar de qu√© manera pod√≠an aportar, y como trabajan con t√©cnicas moleculares consideraron la posibilidad de hacer test diagn√≥sticos por PCR para el SARS-CoV-2. Se apoyaron en la experiencia liderada por los investigadores Gonzalo Moratorio y Pilar Moreno, quienes, a partir de un acuerdo firmado a fines de marzo por el Institut Pasteur, la Udelar y el MSP, montaron un laboratorio diagn√≥stico en el Pasteur, empezaron a hacer la secuenciaci√≥n gen√©tica del virus y dise√Īaron los kits diagn√≥sticos ‚Äďelaborados por ATGen‚Äď que ahora constituyen entre 55% y 60% de los test que se usan en Uruguay, seg√ļn dijo el ministro de Salud, Daniel Salinas el viernes, en la ceremonia de inauguraci√≥n el laboratorio rochense. Adem√°s, el equipo de Moratorio y Moreno hizo la transferencia tecnol√≥gica de lo aprendido, es decir, ayud√≥ a montar otros laboratorios a manipular y procesar las muestras del SARS-CoV-2. El equipo del CURE fue uno de ellos, y para eso visit√≥ el laboratorio de virolog√≠a molecular del Pasteur y la Facultad de Ciencias: ‚ÄúPrimero fuimos para all√°, lo vimos, nos terminamos de convencer de que era posible, que era algo que estaba a nuestro alcance, y luego ellos vinieron hasta ac√° con el laboratorio reci√©n instalado y ah√≠ mismo hicimos el entrenamiento in situ‚ÄĚ, detall√≥ Alonso en la presentaci√≥n del viernes. Entre los apoyos tambi√©n estuvo el del vir√≥logo Rodney Colina, que lidera el laboratorio de la Udelar en Salto.

‚ÄúNos faltaba una pata muy importante, que era poder lidiar con cuestiones que tienen que ver con la salud‚ÄĚ, transmiti√≥ Alonso, pero la soluci√≥n estaba al alcance de la mano: las sedes universitarias del interior del pa√≠s ofrecen diferentes orientaciones, son multidisciplinarias, como dijo la investigadora el viernes, y entonces integraron a estudiantes avanzadas ‚Äďy docentes‚Äď de la Licenciatura en Enfermer√≠a que se dicta en el CURE. La enfermer√≠a aporta su conocimiento en la manipulaci√≥n de las muestras, en la desinfecci√≥n del √°rea, en el uso de los equipos de protecci√≥n personal y en la forma en que debe hacerse la trazabilidad y el registro de las muestras.

La proyección
‚ÄúNo nos contentamos con ser t√©cnicos, que es lo que se necesita en este momento, sino que queremos generar conocimiento‚ÄĚ, expres√≥ Alonso el viernes. Adem√°s de se√Īalar la articulaci√≥n que se gener√≥ dentro del CURE y del CURE con cient√≠ficos de la Udelar y del Pasteur, resalt√≥ un tercer nivel de articulaci√≥n: la del llamado ‚Äúconsorcio Fronteras‚ÄĚ. Ese equipo est√° conformado por investigadores del Centro Universitario Regional Litoral Norte de la Udelar, de la Facultad de Ciencias, del Institut Pasteur, del Instituto de Investigaciones Biol√≥gicas Clemente Estable (IIBCE) y ahora del CURE, y tiene el objetivo de contribuir a la vigilancia epidemiol√≥gica mediante el uso de t√©cnicas moleculares. Formalmente, este proyecto se titula ‚ÄúVigilancia epidemiol√≥gica de la covid-19 en las fronteras uruguayas y an√°lisis de su transmisi√≥n local en el interior del pa√≠s‚ÄĚ, y acaba de ganar un fondo extrapresupuestal por intermedio de la Fundaci√≥n Manuel P√©rez de la Facultad de Medicina.

Alonso explic√≥ en qu√© consiste la vigilancia epidemiol√≥gica molecular: ‚ÄúEn este momento una de las claves de que Uruguay pueda tener bajo control la situaci√≥n sanitaria es que est√° haciendo un muy buen testeo y un muy buen rastreo de los contactos que dan positivo. El rastreo se hace por m√©todos de epidemiolog√≠a cl√°sica de seguir a los contactos que dieron positivo, pero eso, como cualquier metodolog√≠a, tiene sus limitaciones: se requiere un esfuerzo brutal de la gente para estar investigando esos contactos, y un complemento que surge interesante a ra√≠z de las t√©cnicas que manejamos con otros objetivos para nuestras investigaciones es poder hacer un rastreo a nivel de los genomas de los virus‚ÄĚ. Detall√≥ que es un virus que muta r√°pidamente y que analizar sus variantes permite conocer c√≥mo y cu√°ndo entraron al pa√≠s las que causaron determinado brote. Este equipo fue el que determin√≥ que los brotes de covid-19 en Rivera y Treinta y Tres fueron introducidos desde Brasil y que eran diferentes variantes. ‚ÄúNo es lo mismo tratarlos como focos independientes que tratarlos como si fueran el mismo‚ÄĚ, dijo Alonso, y a√Īadi√≥ que esta vigilancia ‚Äúda la pauta del grado de circulaci√≥n que est√° teniendo cierta variante en cierto lugar, que puede ser una ciudad, un barrio, una regi√≥n del pa√≠s o todo el pa√≠s. Podemos ir rastreando c√≥mo se va moviendo el virus, por un lado, mediante la epidemiolog√≠a cl√°sica con los contactos y, por otro lado, mediante la epidemiolog√≠a molecular, analizando el genoma del virus‚ÄĚ, especific√≥.

Con fondos viabilizados por la Fundaci√≥n Manuel P√©rez, el consorcio apuesta a extender a los laboratorios del interior del pa√≠s la tecnolog√≠a de secuenciaci√≥n del virus que han desarrollado los investigadores del Pasteur y de la Udelar. Uno de los anhelos es alcanzar una escala que permita hacer las secuenciaciones ‚Äúen tiempo real‚ÄĚ, lo que permitir√≠a tener una trazabilidad de los focos en cuanto se detectan los primeros casos, y Alonso apunta que Uruguay tiene una escala de casos que permite hacer esa secuenciaci√≥n en tiempo real. Para esta apuesta, el CURE integra tambi√©n a bioinform√°ticos, que son los encargados de analizar e interpretar los resultados.

‚ÄúLa idea es no solamente poder generar los resultados, sino adem√°s poder generar la infraestructura y el conocimiento y que eso quede capitalizado en los diferentes laboratorios que est√°n participando en ese consorcio, porque hoy es esto pero ma√Īana puede tener otra aplicaci√≥n‚ÄĚ, a√Īadi√≥ la investigadora, como mirando m√°s all√° de la pandemia.

Articulación, democratización y soberanía
El Laboratorio de Análisis de Covid-19 en Rocha fue posible por la articulación interinstitucional, destacó el viernes Javier Vitancurt, director de la sede de Rocha del CURE. Por eso entre los oradores estuvieron la intendenta de Rocha, Flavia Coelho, el director departamental de Salud, Diego Pintado, el ministro de Salud, Daniel Salinas, y el rector de la Udelar, Rodrigo Arim. También apoyaron ASSE y la sociedad civil, porque una cooperativa de trabajo aportó gratuitamente al montaje del laboratorio.

‚ÄúNo es arte de magia‚ÄĚ, subray√≥ Arim, quien salud√≥ la acumulaci√≥n de conocimiento generada por los investigadores y su contribuci√≥n para pensar soluciones para enfrentar la emergencia sanitaria, aunque eso implique apartarse de sus proyectos y un sacrificio extra, en muchos casos no remunerado. Record√≥, adem√°s, la apuesta de descentralizaci√≥n de la Udelar, que comenz√≥ hace m√°s de una d√©cada con el fin de ‚Äúreducir las brechas en t√©rminos de conocimiento avanzado y, en el territorio nacional, generar ofertas acad√©micas de calidad‚ÄĚ, y que permiti√≥ radicar en el interior del pa√≠s a docentes de Montevideo y del exterior con un alto nivel de formaci√≥n.

Tanto Arim como Salinas hablaron de soberan√≠a nacional. ‚ÄúEs un orgullo estar en este centro donde se democratiza la ense√Īanza‚ÄĚ, dijo el ministro. Coment√≥ que los investigadores de la Udelar, del Institut Pasteur y del IIBCE ‚Äúhan jugado un rol preponderante al momento de desarrollar y de generar soberan√≠a‚ÄĚ, porque crearon y aportaron los test diagn√≥sticos cuando eran retenidos por los pa√≠ses que los produc√≠an. Salinas estuvo un buen rato recorriendo el nuevo laboratorio y qued√≥ maravillado. ‚ÄúEsto no es algo que nace en forma espont√°nea, es la acumulaci√≥n de los √ļltimos 25, 30 a√Īos, y en especial de los √ļltimos a√Īos, con el impulso a la investigaci√≥n y el impulso a los investigadores j√≥venes por medio de la ANII [Agencia Nacional de Investigaci√≥n e Innovaci√≥n], la Udelar y el Institut Pasteur‚ÄĚ, afirm√≥.

Fuente: La Diaria

Source: https://marcapaisuruguay.gub.uy/el-laboratorio-de-la-region-este-de-udelar-de-la-ecologia-acuatica-a-los-analisis-clinicos-de-covid-19/

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